Witam.
Mam problem. Czy placówka przedszkolna działająca ze zezwoleniem gminy i mająca od niej dofinansowanie musi się zarejestrować na NIP-2 i uzyskać Regon? Czy może osoba prowadząca powinna "wziąć" ją na swoją działalności i zarejestrować się w CEIDG?

Taka jednostka musi mieć, i zapewne ma, REGON. To skutek działania SIO. Poszukaj jej tu.
W sytuacji gdy jednostka zatrudnia pracowników, jest płatnikiem i powinna mieć nadany NIP. Były jakieś mętne pisma MF w tej sprawie. Taka jednostka jest "jednostką organizacyjną nie posiadającą osobowości prawnej", więc NIP-2 jak najbardziej jest właściwy, a osoba fizyczna jest jej "organem prowadzącym" i fakt jej istnienia bądź nieistnienia w CEIDG nie ma żadnego znaczenia.

Jeśli ustalimy kto to jest "placówka przedszkolna" to reszta jest bułką z masłem  

- placówka wychowania przedszkolnego
- placówka unijna, czyli przedszkole oraz inna forma wychowania przedszkolnego (punkt przedszkolny i zespół wychowania przedszkolnego), która jest finansowana z projektów Unii Europejskiej

W art. 2 ustawy o systemie oświaty znajdujemy następujący katalog:
System oświaty obejmuje:
1) przedszkola, w tym z oddziałami integracyjnymi, przedszkola specjalne oraz inne formy wychowania przedszkolnego;

A tą placówką zawiaduje: osoba fizyczna, osoba prawna czy też jednostka niemająca osobowości prawnej  

Placówką zawsze zawiaduje osoba fizyczna - kierownik placówki.
Chodziło Ci zapewne o "organ prowadzący". Organem prowadzącym nie może być jednostka nie mająca osobowości prawnej  ( patrz art.3 pkt.5 oraz art.5 ust.2 ustawy z dnia 7 września 1991 r. o systemie oświaty).

Jeśli osoba fizyczna prowadząca działalność gospodarczą w pisaną do CEIDG staje się organem prowadzącym jednostkę oświatową to powstaje wtedy sytuacja taka że zarówno ta osoba jak i jednostka mają nadane REGON. Po obejrzeniu wpisów w REGON sytuacja trochę się wyjaśnia, gdyż jeden z nich przypisany jest OF z DGOS wpisanej w CEIDG a drugi powstałej jednostce organizacyjnej nie mającej osobowości prawnej. Są to jedna dwa różne podmioty i dla celów ewidencji podatników i płatników powinny być zidentyfikowane oddzielnymi NIP.
Taki stan skutkuje między innymi efektem zapewnienia funkcjonowania jednostki oświatowej w przypadku nagłego ustania bytu prawnego organu prowadzącego będącego osobą fizyczną, potocznie nazywanego zgonem. Osoby zatrudnione w jednostce nie tracą automatycznie zatrudnienia  w wyniku ustania bytu prawnego jednej ze stron zawierających umowę o pracę.

Ja mam inny problem z doborem odpowiedniego formularza nip.
Mam osobę fizyczną, która dostała w spadku po ojcu dwie jednostki szkolne,pierwsza to liceum ogólnokształcące zaoczne druga to zasadnicza szkoła zawodowa.Każda z tych szkół wpisana jest w Urzędzie Statystycznym odrębnie, obie szkoły wpisane są z ewidencję szkół niepublicznych przez prezydenta miasta.Obie szkoły oczywiście są własnością krajowej osoby fizycznej, która nie jest wpisana w CEIDG.
Jaki formularz zastosować Nip-7 czy Nip-2?

Najlepiej trzy formularze.
Wymienione przez Ciebie dwie jednostki powinny być zidentyfikowane, każda z osobna, za pomocą NIP na podstawie NIP-2, jako "jednostki organizacyjne nie mające osobowości prawnej", a osoba fizyczna jest "organem prowadzącym" i powinna być na NIP-7.