Przede wszystkim, zgodnie z art. 285a par. 1 i art. 285b Ordynacji podatkowej, kontrolę można prowadzić w miejscu przechowywania dokumentacji (a więc np. w biurze rachunkowym) a za zgodą kontrolowanego - w siedzibie organu podatkowego. Przepisy Op są ważniejsze niż usdg, gdyż mają charakter szczególny. Regulują kontrolę podatkową a usdg określa tylko ogólne ramy dla kontroli przedsiębiorcy, natomiast różne ustawy regulujące działalność poszczególnych struktur administracyjnych te ramy doprecyzowują.